Le jardin botanique de la faculté est, avec le jardin Nicolas Boulay (faculté catholique) et le jardin des plantes de la ville de Lille, l’un des trois jardins botaniques de la métropole. S’inscrivant dans une longue tradition remontant au XVIIesiècle, ce jardin a été créé en même temps que la nouvelle implantation de la faculté de pharmacie en 1970.
Dans les facultés de pharmacie françaises, l’enseignement de la botanique systématique tient une place importante : plus de la moitié des molécules actuelles des médicaments sont issues ou inspirées de modèles végétaux. Aussi, il est important que les étudiants puissent reconnaître les familles de plantes médicinales, toxiques, ou à l’origine de synthèses de molécules. Ce jardin est naturellement piloté par les enseignants-chercheurs du département de botanique et de matière médicale, depuis l’origine.
Au départ, ce jardin fonctionnait uniquement sur le bénévolat mais depuis 1994, grâce à l’embauche d’un jardinier affecté aux collections, ces dernières se sont étendues et la gestion et l’étiquetage ont été refaits et complétés. En même temps, des crédits « valorisation des collections universitaires » attribués par le ministère de la recherche ont permis aussi la réfection et l’équipement de la serre tropicale et l’aménagement d’une nouvelle salle pour les herbiers. Ces efforts ont été salués en 1999 par l’attribution du label « jardins botaniques de France et des pays francophones, réseau auquel le jardin participe activement, en liaison avec le BGCI (Botanic Gardens Conservation International).